XcodeとCommand Line Tools for Xcodeは別物です。
xcode-select
インストールされているXcodeのバージョンを指定するもの。
同一Mac上に複数のXcodeがある場合に、どのXcodeを使用するか指定する。
XCode
XCode本体。
AppleのAppStoreからダウンロードできる。
高機能エディタやObjective-CのIDE、Command Line Tools を含んでいる。
Command Line Tools for Xcode
Xcodeに同梱されている、便利なコマンドが収録されたライブラリ。
Xcode-select —install により、本Command Line Tools だけをインストールすることができる。